Năm 2004, Jesse McCartney tham gia vào bài hát "Come Together Now", một single từ thiện để ủng hộ những nạn nhân của cơn sóng thần Tsunami năm 2004 và cơn bão Katrina năm 2005.

Năm 2005, McCartney đăng ký làm người ủng hộ chính thức của Little Kids Rock, một tổ chức phi lợi nhuận cung cấp nhạc cụ và dạy học miễn phí cho trẻ em ở các trường công ở khắp nước Mỹ. Anh là thành viên Ban Giám đốc Danh dự của LRK.

Anh đã quyên góp tiền thu được từ chuyến lưu diễn năm 2005 cho các nỗ lực cứu viện thảm họa, thu âm radio để quảng bá chiến dịch "Kids For A Drug-Free America", đóng vai trò phát thanh viên cho Bệnh viện St. Jude Children’s Research và còn tham gia tổ chức từ thiện SPACE, nơi đã được đồng thành lập bởi một người bạn thuở nhỏ của mẹ anh. Jesse trình diễn tại buổi hòa nhạc Hope Rocks năm 2005 để ủng hộ City of Hope Cancer Center.